Há uma divergência semelhante na forma como as duas narrativas de “Fullmetal Alchemist” apresentam o Coronel Mustang. A história de Roy é a mesma; como o “Alquimista da Chama” de Amestris, ele participou de uma campanha genocida contra a nação de Ishval. Sobrecarregado pela culpa, ele procura subir na hierarquia militar para transformar Amestris em um lugar melhor e expiar as vidas inocentes que ceifou.
O mangá e “Brotherhood” não enquadram essa busca como altruísta, mas o braço direito de Mustang, Riza Hawkeye, argumenta que é seu dever; Edward finalmente concorda e decide que vai dar uma olhada no Mustang com ela. A série deixa o futuro do Mustang incerto mas sugere-se que ele eventualmente se tornará o Führer de Amestris e corrigirá os erros do regime passado, incluindo o seu próprio.
No anime de 2003, a busca de Roy Mustang para se tornar Führer é mais uma questão de viver com sua própria culpa; ele diz a si mesmo que pode consertar as coisas porque, caso contrário, não conseguirá continuar. Notavelmente, ele admite que seu objetivo é menos reformar e mais garantir que nunca mais terá que seguir ordens injustas (porque será ele quem as dará). Nesta iteração, ele decide que as rodas da justiça giram muito lentamente e, depois de saber que Amestris Führer Bradley é um homúnculo, o assassina (e descarta seu uniforme militar antes de fazê-lo).
No episódio 48, “Goodbye”, Ed e Roy compartilham uma conversa final sobre sua própria ingenuidade e o primeiro destila sua percepção compartilhada: “Mesmo quando nossos olhos estão fechados, há um mundo inteiro lá fora que vive fora de nós e de nossos sonhos”.